W Polsce wody generalnie są mocno zanieczyszczone a najgorsza sytuacja jest na wyżynie śląskiej gdzie wody zostały przede wszystkim zanieczyszczone przez działalność przemysłową człowieka. Duże nieczystości wód są powiązane z kiepską rozbudową oczyszczalni ścieków zarówno komunalnych jak i przemysłowych. W niektórych regionach kraju oczyszczanych jest tylko do 30% ścieków. Jednak zanieczyszczenie wód to nie tylko punktowe nieczystości np. z fabryk, ale również na dużą skalę, ciężkie do zlokalizowania szkodliwe substancje spływające z parkingów, pól, składowisk odpadów, ulic, terenów budowlanych.

Jakość wody klasyfikowana jest w klasach od 1 do 5. Pierwsza klasa to wody najwyższej jakości i czystości biologicznej. Druga klasa to wody o niższej czystości biologicznej, ogólnie oceniane wody tej klasy są jako dobre. Klasa trzecia to wody, które zastosowanie znajdują głównie do nawadniania obszarów rolniczych oraz wykorzystywane w zakładach przemysłowych. Klasa czwarta i piąta są poza normami, są mocno zanieczyszczone, nie nadają się do wykorzystania. 

Niestety ponad połowa naszych rzek to wody najniższych klas, fatalnej jakości. Co gorsze stan Polskich rzek nie ulega poprawie. Ma to związek z niskimi nakładami finansowymi jakie są kierowane na inwestycję poprawiające czystość wód w Polsce.

Woda posiada zdolności samo oczyszczające, jednak w stosunku do skali zanieczyszczeń na jakie napotyka są one nie wystarczające.